南怀瑾投资与政府合建金温铁路，有许多人对他的动机产生了质疑，认为他是为了自己赚钱及短期的收益，但实际上他的眼光是着眼于未来的、长远的、大众的利益。针对这种误解，他曾说：“修这条铁路，是为子孙后代造福的社会公益事业，并非为了投资赚钱；如果乘机炒地皮，抢利益，不顾公义，只顾私利，那就变成为人民造孽，不是公益的事了。”事实上也如此，如果说只是为了赚钱，他只需要把那一千多万美元放在香港，无论是投资房地产，还是炒黄金炒股票，早就赚到大钱了，没必要如此折腾。
金温铁路动工不久后，南怀瑾又在灯下奋笔疾书，致函浙江省有关领导。他在信中说：“我另所关。者，看来是无事生非的事，那就是希望金温铁路沿线经过的平川地段，一边筑路，一边植树造林。苟能如此，虽稍加预算，实亦造福后代的要着。”